合同的特点是明确、详细、具体，并规定有违约责任;而协议的特点是没有具体标的、简单、概括、原则，不涉及违约责任。从其区别角度来说，合作协议是签订合同的基础，合同又是协议的具体化。
合同与合作协议是两个既有共同点又有区别的概念，不能只从名称上来区分，而应该根据其实质内容来确定。如果合作协议的内容写得比较明确、具体、详细、齐全，并涉及到违约责任，即使其名称写的是协议，也是合同;如果合同的内容写得比较概括、原则、很不具体，也不涉及违约责任，即使其名称写的是合同，也不能称其为合同，而是协议。
一般情况下都要合伙协议的，没有的话必须要有第三方证人
一般情况下都要合伙协议的，没有的话必须要有第三方证人
公司+农户养殖合作合同是有效的。
公司加农户，就是将经营性公司与养殖农户联结起来的生产经营模式，是一种助农增收、农民致富的新型农企联合模式。公司＋农户有两种合作模式:一是企业与农户以签约形式建立互惠互利的供销关系，包括合资、入股的紧密型联合及不受合同约束的松散型联合。二是以具有实力的加工、销售型企业为龙头，与农户在平等、自愿、互利的基础上签订经济合同，明确各自的权利和义务及违约责任，通过契约机制结成利益共同体，企业向农户提供产前、产中和产后服务，按合同规定收购农户生产的产品，农民按企业要求组织生产，产品按合同交企业收购，从而建立稳定供销关系的合作模式。
无论哪种合作模式，其签订的合同都是有效合法的，应遵守。无论农民或企业违约均应承担责任。而企业＋农户的联合体(专业合作社）对外签订的购销合同同样具有法律效力，应遵守并执行。
有效！公司加农户养殖合同是有效的。公司和农户双方是在一个平等的基础上。签订的一个文本合同。合同中约定了双方的义务和权利。也是得到双方的认可后。而签订的一份正式的正式有效的合同。这份合同在国家也是承认。具有一定的法律效应。